Eine Bedeutung von en ist ja tatsächlich im. Folglich macht es Sinn, dass man en auch bei Fortbewegungsmitteln benutzt, immerhin befindet man sich ja in der Regel darin, wenn es sich bewegt.

en = en
Il va à Paris en voiture.
Er fährt mit dem Auto nach Paris.
Il va aux Etats-Unis en avion.
Er fliegt in die USA.

Aber (in krassem Gegensatz zum Spanischen, also Stolperfalle):

in einem Fahrrad befindet man sich nicht
Il va en ville à bicyclette
Er fährt mit dem Fahrrad in die Stadt.